一、選擇適當的時間和溫度使用微生物菌肥。

（1）使用微生物菌肥最好是在作物根系附近施用，最好是在作物的生長旺期前7-10天和后7-10天施用。

（2）適宜的土壤溫度是20-30℃。

（3）微生物菌肥不宜存放過久，否則容易造成效果降低。

二、選擇正確的施用部位和方法使用微生物菌肥應盡量避免將其施在地表，因為地表處溫度較高，容易使菌死亡；也不要將其施在根頸部，因為根部吸收水分和養分的能力較弱。一般應施在根系附近的土表或溝內。同時還要注意，不要將菌肥直接與農藥等有害物質混合施用。